
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化突显蛋白酶组学产品,实现1000+艰深度掩盖位点验出,平稳再现精品靶点,全位子生信具体分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“查证”全流程图服务保障,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、测试步奏
02、场地实测数据显示
03、经“点”重新
在测量数据分析中,检测两个专著中新闻稿件的精品靶点和其衣康酸呈现位点,如首位个被发掘的衣康酸共价呈现淀粉酶KEAP1,再有糖酵解信号通路中的3个要素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各类炎性小体组合淀粉酶NLRP3和体细胞烂掉步骤中的要素淀粉酶RIPK3等,其质谱图如下所述图如图是。
04、产品的共同点
1.众多质控
金融业化特异形测试探针孵育、SDS-PAGE论文验测、WB校验、样品涉及性讲解等供需双多方面论文验测,加强组织领导工作报告单可信度性。2.高性质谱实验仪器服务平台
在Orbitrap Astral全最新一代名将高签别质谱仪火供下,建立衣康过酸淡化位点及血清检测新淬硬层,转向科学有效深入分析新出现 。3.全程序流程站台式提供服务
特征提取拜谱生物工程完整的科学实验机构,可出示“上皮细胞培训→探头孵育→WB验测→深奥度衣康硝化作用修饰语验测→独属生信讲解→相关位点PRM查验”全程序精准服务,省时省钱更贴心。05、解析资源(部件)
06、应运目标
PART 2、文献资料微信分享
文献综述一
英文怎么说网站标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文翻译主题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
的研究内部:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
参考文献二
国外英文微信标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
汉语小标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
论述网站内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、事例衍生产品思维
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13极具不强的底物构建本事,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱海洋生物衣康过酸呈现组监测统计数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸装饰(下面的图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结
身为TCA循环系统中的在期间分解分解物,衣康酸上下调整分解分解、免疫系统系统检测和真菌感染互相的完美做用,为控制免疫系统系统检测真菌感染性疫情保证了充当控制攻略。衣康酸空间格局中的亲电性α,β-不趋于稳定羧酸空间格局能对蛋清质上的化学活化半胱氨酸残基实现烷基化遮盖语语(迈克尔加的作用),某种翻泽后遮盖语语被分为“衣康酸遮盖语语(itaconation)”,借以损害蛋清质职能,宏观调控免疫系统系统检测对答和分解分解有效途径,为四种疫情口服药产品研发保证新一个构想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用淡化蛋白质组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床相对一定量靶向药物消化吸收组(QMT1000)或能量消耗细胞代谢转化靶向疗法细胞代谢转化组服务对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
可以参考期刊论文
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.