
近日,杭州医科高校第一名其他门诊王学浩中科院院士开发团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶点动能新陈代谢检测分析服务。
英文字母题头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文翻译题头:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
顾客组织:南京医科大学
学习素材:细胞
拜谱带来服務:转录组测序+蛋白质互作组+靶向治疗电能分解组
技术设备路经:
论述毕竟
01、YBX1被签定为HCC中糖酵解的关键点染色体
本探析收采HCC肺部恶性淋巴肺部肿瘤样本量(n=7)的单企业RNA测序数值报告集开展研究,知道糖酵解活性氧重要分布在肺部恶性淋巴肺部肿瘤企业中,hdWGCNA研究识別出9个基因遗传引擎(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的极限荒岛生存研究断定YBX1为经济独立极限荒岛生存风险隐患原则(图1H)。进这一步综合IHC、WB实验操作和肺部恶性淋巴肺部肿瘤企业与最靠近非肺部恶性淋巴肺部肿瘤企业的范围转录组学数值报告集核实YBX1是肝企业癌治愈的不确定性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确认为设定HCC细胞系糖酵解的核心元素
02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点人体脂肪代谢转化组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1加快HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1融入并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密结合并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化怎强其磷碱化,导致有助于其核转位
提高认识一个脚印检验YBX1的O-GlcNAc糖基化能不能应响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC细胞膜核中或用OGT可以调节剂OSMI-1整理,YBX1血清程度明显缩减,YBX1磷硝化作用明显减低(图4A-C)。IP实践表示,在一致的Flag-YBX1底物程度下,YBX1-WT的磷硝化作用程度明显优于YBX1-T57A,证明磷硝化作用的扩大不单仅是由于更快的YBX1血清形容(图4D)。剥离 了核和质混合物遇到TMG整理的HCC细胞膜核中YBX1核形容的提升(图4E-F),提高认识一个脚印遇到YBX1磷硝化作用的根本可以调节细胞是AKT(图4G-I)。那些遇到体现了O-GlcNAc糖基化采用促使其磷硝化作用来使得YBX1血清动态平衡性并促使核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 突显有弊于其进步情况磷碱化突显并可以加快其核转位
05、YBX1促使PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有助于PKM2转录
06、YBX1 可以提高自己组淀粉酶乳酸性反应体现含量
科学研究挖掘YBX1敲低明显较低血清酶质乳酸性反应,尤为是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解克药物2-DG的进行实验灵魂具有了糖酵解与组血清酶乳酸性反应的直接的的连接,克制糖酵解可明显较低H3K18la水平面(图6D)。PKM2过理解可逆转转YBX1敲低所至的H3K18la变低,之外源乳酸解决不单的提升H3K18la,还伴YBX1理解上浮,报错具有朝信息反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR灵魂具有,H3K18la可以通过生物富集于YBX1通电子直接的的利于其转录,该的过程 受O-GlcNAc糖基化宏观调控(图6H-J),并挖掘P300 上浮是YBX1增进H3K18乳酰化做用的措施(图6K-L)。
图6.YBX1增进H3K18乳硝化作用体现平均水平
句子工作小结
在这些分析中了解了YBX1在HCC中高描述方法,还有就是与糖酵破解切想关。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,而使比较稳定血清质并加剧其描述方法。这类突显还增強YBX1在T57处的磷碱化,增強其核易位。故而,这些过程中 增強了糖酵解想关dna的转录并有趣乳酸的会产生。除外,YBX1缴活P300的转录,接着驱程组血清的乳碱化,尤其是H3K18la,H3K18乳碱化朝国家宏观调控YBX1dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传规律正反面馈环管理机制图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱菌物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向疗法能源代谢率组技术服务,拜谱动物建立了完善成熟的转录组学、血清组学、翻译英语后遮盖组学、分解代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
考生论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.