
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生态学 为其提供 TMT蛋白质组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究探讨最后
理论研究师实验设计精力推移速冻精力提高牛羊肉的洛氏抗拉强度、持水专业能力、色调、分离铁份量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4级别来评估报告肌肉群组织安排血细胞膜的铁意外死亡状况。最终结果展示,速冻精力提高后,牛羊肉的洛氏抗拉强度在第四天和第6天不错走低;持水专业能力较低;的颜色变深,丧失光泽度,鲜网红转变成暗网红。不仅而且,分离铁、化学活化氧和MDA的份量不错不断增加,血细胞膜凋亡率不错增大。 研究方案人提炼不一样的冰箱周期的肌群打样定制的淀粉酶质,进而开始SDS-PAGE深入分析一下,淀粉酶质条带在不一样的时段布置粗糙且类似于(图1a)。通过淀粉酶在不一样的打样定制中的表达方法情况下,深入分析一下发掘同组打样定制的中四位数贴近于同平行(图1b),反映肌群打样定制淀粉酶质有着不错的组内类似于性和组间之间的关系性。 球营养物质组学共判定出1996种球营养物质。以B0为参考组,建立B1、B2、B4和B6中的球球蛋白酶酶酶做相互影响表明爱分折,共判定到375个DEPs。将火山图可视化概述,并会按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种要求分折DEP。成果如图甲下图1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别判定出22、33、73和140个DEPs,在当中分刘海别调整6、11、32和89个,下降16、22、41和54个。聚类分析方式评估方法了性别差异冷冻冷藏阶段性力量企业中球营养物质的表明爱,成果表现力量球球蛋白酶酶酶表明爱相互影响随着时候推移儲存时候的增高而增高(图1g)。
图1| 不同于速冻耗时的肩部肌肉样品管理血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同于保鲜时间段的身体肌肉土样的差异蛋白质分析一下(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡视频蛋白质肽的PRM按量分折(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 特征提取KEGG丰度差异化描述蛋白质的铁伤亡规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物学提供了TMT化学发光法蛋清酶质组学技术性应用服务培训质量,拜谱生物技术性已服务培训开发进行并建立起了健全完善完美的转录组学、蛋清酶组学、代谢率组学、两组学协同服务培训技术性应用服务培训质量体系建设,欢迎致电咨询!
参考使用学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.